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首先，這個問題的範圍主要是以物理科系，或更進一步的化學科系的電化學來探討才能明白其中的問題。一般機械、電機、電子、化工、化學與車輛學門的，懂其一不懂其二，其三就不用多說了。 而實際的理論與基礎研究，以下不多談，以您能明白的方式來進行表達。但有些必須要先提的原理，還是需要您去理解一下才行。
首先，直流電力系統是不接地的！由於直流電的特性具有單方向的問題，可造成很多電磁與化學上的問題，最直接的就是漏電流造成的電化學腐蝕問題。
再次提到所謂的電氣連續性問題。也再次強調電氣連續性並不是單指阻抗值低。也就是一般人所稱的低電阻。以下引用基本電化學書中的引述：(界面現象：雙電層)
任何一對不是完全相同之導體接觸所形成之界面，不論導體的固相、液相或氣相都會有電位差（potential difference）存在，它的大小，不但與其組成有關，而且和它的相的本性有關。有許多類型之界面，其界面現象是實用且重要的，例如：
a.金屬/電解質溶液
b.金屬/金屬
c.電解質溶液/電解質溶液
d.低濃度溶液/半滲透膜/高濃度溶液
以上也就是說，當您把銅線接到鋼鐵的車架上時，即造成了雙電層的效應。銅金屬與鐵金屬間則非為良好的電氣連續性！由於其它的電化學反應，該點的結構(強度及鋼性)將會變差。
再者，順磁與逆磁的特性(離子結構討論)，將會使有流經電流的金屬有一定方向的改變，也是會影響其結構。而且，且有較高電子濃度的區域，金屬會更有機會與空氣中的氧氣反應，成為均勻腐蝕的一種。整體而言，就是會提早老化！
(另外，電是走導體表面，頻率愈高走愈外面，低者走裡面，熱力學第一定律：能量守衡定律，若能量不被電氣設備吃掉，就是被線路吃掉，線路包含車架的話，車架上怎麼耗去能量..變質啊)
而車架並不是整個都是由模鑄出來的，而是一段一段銲起來的。而有所謂搭鐵的地方，則是由銅線達成。這些接合界面上，則更可能造成雙電層現象與電化學腐蝕問題。(你要特別注意，較早之前，較正確的說法，是搭鐵，而不是接地喔，那是後頭錯誤的文字用法，大家不懂又當真，所以才錯到現在的局面)
以上尚未討論到電流在不同金屬上流動的速度，一般人也只懂電阻，但電阻與流動的速度又不同。阻抗的高低不是用三用電錶量得出來的。所以同一個負載的回流電力，若分由銅線與車架兩迴路回到電源系統中，則會有磁場不平衡的問題。說正格的，整個問題相當的多。可以再寫篇論文出來。但寫出來又如何...沒人理啊！若你真的有興趣，想找出最佳方法，可以到大學圖書館去借電化學相關的書，都在討論這些。另外電學與材料力學也要去看。這樣再配上電機與車輛工程，才能通。
以上，簡短的說一下，不建議做所謂的車體「強化接地」這種措施。以下直接回答您所需要的答案：
(1)電源負極要搭鐵、負載負極也要搭鐵。進行搭鐵的部份無法說幾條，而只能說有那些部份。首先電源一定要搭鐵，基本上發電線圈沒有搭鐵，而是到整流器後，由整流器負極當散熱器並搭鐵。故而，在裝整流器的位置，其與車架接觸面需要清去烤漆，使整流器外殼直接與車架接觸，另外，固定整流器的螺栓也接一條電線再與車體相接。強烈建議整流器接引出來標準的黑色線(負極)要接到一個端子台上，該端子台可以再與蓄電池負極連接，同時與整台車的其它負載負極連接。 回到負載的部份。小電流與短時間反應的負載不必理它，如大燈、點火系統、尾燈的部份，則需要進行強化搭鐵的動作。若可能的話，建議直接將負載的負極接引回端子台，這樣的動作是最完整與完美的。另外在點火系統上，由於其為強電特性，建議採用品質良好的軟銅線進行搭接，若只用一般硬抽銅線，很快就會變質，同上頭所說的材質直流電的問題。汽缸頭的搭鐵是接到高壓線圈去，而不是接到端子台喔，別把強電打回一般系統！ 而高壓線圈是怎麼樣的型態依各車種，有的不同！一般是有共通點，但還是一樣。那裡是由CDI或ECU獨立送電，不要接回端子台就對了。
(2)start motor(中譯我譯不出正確的)吃的電力極大，也建議直接將其負極接引至端子台。其直接接至蓄電池的效能並不大，蓄電池的一個電樁頭要壓兩片不同的迴路，則是接點愈多缺點愈多！可以的話，蓄電池用粗一點的軟銅線接至端子台即可。當然，電力由那個電源給那個負載是要區分好，才能發揮最佳效能。若你夠仔細，前述有很多隠藏技巧，能有極大的改善空間。專用迴路當然遠比共同迴路好，只是原廠在成本考量下，一定採用共同迴路。
2007-05-06 03:48:04 補充：
(3)降低損失是第一個首要條件，以上的做法，都在減少損失。您若是想要引擎有力，這個說實際點，是內燃機學門的事，在無法改變CDI或ECU點火角度的前提上，光想要以搭鐵來達成，是很難的。但專用迴路的使用，可以使點火系統上的雜散電容效應及其它問題減少，可以讓它高壓波型較佳，配合正確的點火間隙及火星塞，的確可以發揮更好的點火效率來達到大一點點的爆炸力(扭力)，及整體行駛上的順暢性。
2007-05-06 03:48:14 補充：
在這個上頭，也有著很大的改善空間，不過那快要成knowhow的範圍嘍！ 實際上很多人改導線的觀念不正確，並無法發揮出最佳的效能。 在系統的環境下，最重要的就是協調與匹配。(能量不變下，電壓高電流小，電流大電壓就低，所以點火要很協調才行，亂搞或只搞一種是外行的作法，阻抗一定要匹配..太傷人的就不講了)
2007-05-06 03:48:24 補充：
機車上，是一個變動電壓與變動電流的環境。同H.I.D之安定器一樣，看你需要定電壓或定電流型的東西，對整體電氣特性都會有較佳的表現。如大燈要亮，不是裝增壓器，須要裝定電流的裝置，用電晶體即可達成。不過都要依不同燈泡下去進行設定才行。而定電壓，那也還好，做個DC to DC的Inverter來用，使其無論電源電壓如何，負載側電壓都固定。(這個是一般較易接受的東西)，不過，此時可能蓄電池的負擔就比較大嘍！
2007-05-06 03:48:55 補充：
接線去搭鐵，並不會加強電流。因為整個電氣系統中，只有電源與CDI是主動元件，它們才有能力控制電流，其它的都是電壓型被動元件，基本阻抗不變，隨電壓而改變電流。
有在蓄電池與大燈間接專用迴路(卻造成系統?定度與可靠度的影響，爽了大燈，害了系統)，也只是跳過車架與共同迴路的損失而已。若直接處理掉車架與共同迴路的損失不就好了！太多細節無法一一多談，有賴您細心挖掘嘍！
2007-05-09 00:50:20 補充：
H.D.C版大，小弟的回答您收到了嗎？收到了，回我一下，我想刪了！